Der Regisseur und Drehbuchautor John Patrick Shanely (Mondsüchtig) verfilmt mit Glaubensfrage sein mit dem Pulitzer Preis ausgezeichnetes Theaterstück. Darin muss sich der an einer Klosterschule tätige Pater Flynn (Philip Seymour Hoffman, Die Geschwister Savage) gegen die Vorwürfe des Missbrauchs erwehren. Die konservative Direktorin (Meryl Streep, Mamma Mia!, die eine andere Auffassung von Erziehung hat, als er, macht daraus einen Feldzug, an dessen Ende der Rauswurf von Pater Flynn stehen soll. Wem sie damit helfen möchte, ist allerdings unklar.